San Fernando cuenta con dos estaciones, la de San Fernando-Bahía Sur y la de San Fernando-Centro, ésta última remodelada y con paso a nivel soterrado, cuando era ministro de Fomento, José Blanco.

A diario son cientos las personas que en cada salida de tren copan las estaciones o hacen cola para sacar el billete, ya sea en máquinas expendedoras o en taquillas. Y grandes masas las que llegan en el tren en las denominadas horas puntas.

Desde Renfe se han contabilizado que en torno a 4.000 isleños usan a diario los trenes de Cercanías. En congreso, los usuarios que salen o llegan a San Fernando en los trenes de Cercanía está en torno a los 4.000 viajeros diarios. Una cifra que responde a la suma de las dos estaciones de San Fernando-Centro y San Fernando-Bahía sur.

Renfe pon en servicio 54 trenes de Cercanías diarios entre Bahía Sur y Cádiz, siendo 27 por sentido. Hacia Jerez, la oferta es de 46 trenes diarios, 23 por sentido, y son muchos los isleños que lo utilizan para desplazarse a la Universidad de Cádiz, en sus distintos campus, o para trabajar. El Servicio de Cercanías permite también conectar San Fernando con el Aeropuerto de Jerez, mediante 6 trenes diarios, 3 por sentido, lo que demuestra también que el hecho de que el próximo Tren Tranvía de la Bahía de Cádiz pudiera llegar al aeropuerto, para San Fernando no es necesario, pues ya cuenta con esa conexión y con 54 trenes diarios

El mayor número de usuarios de San Fernando se registra en las horas puntas, que van desde las 6:00 horas, hasta las 9:00 de la mañana; de 13:30 a 15:30 horas y de 18:30 a 20:30 horas.